生物与食品工程学院始建于1984年，历经食品工程系、生物化学工程系和生物与化学工程学院，是安徽工程大学最早的四个教学单位之一。学院近40年的发展历程中，秉承“尚德敏学、唯实惟新”的校训精神，以本科生教育为主，大力发展研究生教育，紧密结合专业服务地方社会经济发展，为“国内知名、省内一流的地方特色高水平大学”建设提供强力支撑。

现有食品科学与工程、生物工程和生物制药3个本科专业，拥有生物工程、食品科学与工程2个一级学科硕士点和生物与医药工程专业硕士学位点。生物工程学科在第五轮全国学科评估中取得优异成绩，位居安徽省首列，实现学校历史性突破。拥有安徽省工业微生物分子育种工程实验室、安徽省微生物发酵工程技术研究中心、安徽省生物制品与食品检测检验及其标准化技术公共服务平台、安徽省固态发酵工程技术研究中心（古井共建）、安徽省微生物药物工程技术研究中心（新宇药业共建）、安徽省米制方便食品工程技术研究中心（同福碗粥共建）等6个省级研究平台和生物质发酵省级科研创新团队。学院现有教职工83人，具有博士学位的教师64人，占教职工比例77%，其中具有高级职称34人，占教职工比例为41%，省级教学名师1人，省优秀教师1人。聘请清华大学邢新会教授、江南大学堵国成教授、苏州大学杨凯教授等一批国内外知名学者担任兼职教授和硕士生导师。

近年来，学院先后主持国家自然科学基金、国家农业科技成果转化资金等国家级科技项目20余项，安徽省科技重大专项、安徽省科技攻关计划项目和安徽省自然科学基金等省级科技项目50余项，获中国轻工业联合会科技发明奖、中国产学研合作创新成果奖、安徽省科技进步奖等省部级科研奖励一等奖2项、二等奖3项、三等奖4项，芜湖市科技进步二等奖1项、三等奖4项，获授权发明专利40余项，发表SCI和EI收录论文200余篇。

学院积极推进教学改革与创新，2020年成功获批国家级新农科建设项目1项。食品科学与工程专业获国家级卓越农林人才计划立项建设和国家一流专业，并于2019年顺利通过国家工程教育认证；生物工程专业为省级专业综合改革试点专业和国家一流专业。先后主持国家一流课程1门、省级精品课程5门以及省级教研项目20余项，拥有省级校企合作实践教育基地1个、省级示范实验实训中心1个，获省级教学成果奖6项。

积极开展学校“三全六专”育人实践工作。近年来，多人次在全国节能减排大赛、全国大学生生命科学竞赛、安徽省大学生生物标本制作大赛、安徽省大学生食品设计创新大赛等学科与技能竞赛中获奖。连续多年本科生就业率达95%以上，考研录取率达35%以上，其中2022年为41.23%，2023年为39.97%，2024年为34.65%，连续三年位于全校第一。

目前，学院正在向“深化内涵建设、做强生食学院”的总体目标迈进。